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SUMMARY:The 19th edition of the International Digital Curation Conference (IDCC25)
DESCRIPTION:The 19th edition of the International Digital Curation Conference (IDCC25) will take place in The Hague\, the Netherlands between 17-19 February 2025. \nThe main theme of IDCC this year is Twenty years back\, twenty years forward: lessons and directions in digital curation. \nIDCC25 Programme Announced!\nOver 125 contributions from all over the world make up our programme\, that all meet the theme Twenty years back\, twenty years forward: lessons and directions in digital curation. \nThis year we have created in-person and virtual programme webpages. \nSponsorship and Support Opportunities are open
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SUMMARY:EUDAT Conference 2024
DESCRIPTION:The EUDAT Conference is EUDAT’s flagship event which provides a forum for the latest developments in research data management and enabling tools and solutions. \nGet more details on the EUDAT event page.
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SUMMARY:Introducing TOP 2025: An Updated Framework for Enhancing Research Transparency and Verifiability
DESCRIPTION:Published in 2015\, the Transparency and Openness Promotion Guidelines (TOP 2015) was developed as a policy framework to enhance the verifiability of empirical research claims in journal articles. It has been widely used and adopted by publishers and academic journals\, but despite its uptake\, concerns have been raised about aspects of the TOP 2015 framework and its implementation. In response to the above\, the purpose of this manuscript is to introduce an official update to the TOP Guidelines. The final version—TOP 2025—provides updated guidelines for promoting the verifiability of published empirical research claims. \nRegister for the webinar here.
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SUMMARY:META-REP 2024 – Conference on Meta-Science and Replicability
DESCRIPTION:We are delighted to announce META-REP 2024 – the Conference on Meta-Science and Replicability in the social\, behavioral\, and cognitive sciences. It will be held from October 28 to 31\, 2024 in Munich. The conference is organized by the DFG-funded Priority Program META-REP. \nIn recent years\, replicability\, reproducibility\, robustness\, and validity of empirical findings became a focal and intensively debated and researched topic in the behavioral and social sciences. Aside from an intensive scientific discourse\, these dynamics caused demands for change and innovation. In response to these developments\, the META-REP program is oriented towards three main (meta-)scientific research goals: (1) to define\, describe\, and assess “replicability” (the what-question)\, (2) to provide explanations for replication rates\, heterogeneity and deviation in replication results (the why-question)\, and (3) to assess effectiveness and efficiency of strategies and change aimed at improving robustness (the how-question). We are convinced that many scholars in the fields of the behavioral and social sciences can contribute valuable findings\, ideas\, and discussions to (one of) these three goals. We are excited to provide a platform for the exchange of manifold replication-related research findings and innovation from all scientific disciplines (as well as science communicators\, delegates from funding agencies\, academies\, or science organizations). We thus want to invite everyone whose work relates to one of the manifold aspects of replicability research to attend and/or contribute to META-REP 2024! \nWe hope to see you in Munich\,\nProf. Dr. Mario Gollwitzer\nMETA-REP Program Coordinator \nFind out more HERE.
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SUMMARY:Open Science Week 2024
DESCRIPTION:Focused on Open Science topics from the perspective of funding providers\, is here! \nThe event is online so that you can participate from anywhere. Please register for individual parts of the program. Of course\, it is possible to attend only some of the lectures on a given day. \nPlease note that the majority of lectures will be in Czech. \nThe link to join will be sent to all registered participants in advance. \nRegister HERE.
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SUMMARY:Open Science Conference: EOSC Symposium 2024
DESCRIPTION:Save the date: October 21-23\, 2024\, Berlin\nThe international EOSC Symposium will take place in Berlin in 2024. 450 experts from research and research infrastructures as well as representatives of European science policy are expected in Berlin to present concrete results\, discuss new ideas and promote the future of Open Science in Europe. \nThis outstanding event as well as the high thematic synergies have inspired the Open Science Conference to join forces with the EOSC Symposium to present the topic of Open Science in Berlin in 2024. \nWe can’t wait to welcome you to this exciting gathering of European Open Science stakeholders in Berlin from October 21-23\, 2024. Under the patronage of the Federal Minister of Education and Research\, Bettina Stark-Watzinger\, we would like to cordially invite you to this important symposium. \nPlease save this date. Further information on the program and registration will be provided at a later date. \nFind out more HERE and HERE.
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SUMMARY:Global Evidence Summit 2024
DESCRIPTION:On behalf of our organising partners\, I would like to invite you all to join us for the eagerly anticipated 2nd Global Evidence Summit. This is a unique opportunity for our colleagues across the globe to get involved in evidence-based practice\, with a shared mission to provide a platform to discuss critical issues across different sectors\, including health\, education\, social justice\, the environment and climate change. \nThe main aim of the summit is to provide a multi-disciplinary and cross-cultural platform\, which provides the opportunity for delegates and speakers to exchange ideas about how best to produce\, summarise and disseminate evidence to inform policy and practice\, and using that evidence to improve people’s lives across the world. \nWe are delighted to be hosting this event in the historic city of Prague\, at the O2 universum\, in the heart of this beautiful city from 10-13 September 2024. Please note that Monday 9 September is dedicated to pre-summit meetings. \nThe members of the Global Organising Committee and the many partnership sub-committees supporting the event have been working hard behind the scenes to ensure we deliver an engaging and important programme for now and for the future around the following themes: \n\nSustainable development agenda\nThe importance of research integrity making evidence accessible\nPower of synergy in evidence synthesis & synthesis products\nEvidence translation & implementation\nAdvocating for greater evidence communication & use of evidence\nGlobal evidence to local impact\n\nIt has been six years since the first event in Cape Town\, and as you know\, we have been waiting for quite some time to be able to host the second summit\, so we really do hope to be able to connect with many of our members\, partners and colleagues. See you in Prague! \nFind out more HERE. \nMiloslav Klugar\nChair of the Scientific and Local Organising Committee 
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SUMMARY:8th World Conference on Research Integrity (Hybrid)
DESCRIPTION:Invitation by the co-chairs\n\n\n\n\nWe invite you to the 8th World Conference on Research Integrity\, which will be held from June 2 to 5\, 2024\, in Athens\, Greece. The biannual WCRIs cater for all disciplinary fields\, all professional ranks\, and all career stages\, and involve all stakeholders in research integrity\, including universities\, research institutes\, research funders\, publishers\, and governments. The conferences are lively and interactive\, and the program consists of a mix of research findings\, reflection and policy development. Conferences typically produce an influential policy statement such as the Singapore Statement\, the Hong Kong Principles and the Cape Town Statement. \nWCRIs take a strong view on ethnic\, gender\, geographical\, disciplinary and career stage diversity and ensure that this is reflected in the programme\, the keynote speakers\, the committee members\, and the participants. We give special attention to early career professionals and we organise a doctoral forum\, workshops\, and meet-the-expert sessions for them during the conference. \nFind out more HERE.
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SUMMARY:KU Leuven Open Science Day 2024
DESCRIPTION:The Open Science Day is an opportunity for KU Leuven researchers to share their Open Science experience\, and to participate in the discussion. The next edition will take place on 6 May 2024. It will take the form of an Open Science fair with posters and stands by KU Leuven researchers\, next to a panel debate about the position of early career researchers and their supervisors in a research landscape which is moving towards more Open Science. \nAccepted proposals will be published in the proceedings of the KU Leuven Open Science Day. For posters\, we will publish abstract\, biography of the author(s)\, the posters in a downloadable format and (if desired) additional materials. For demos\, we will publish abstracts\, biography of the author(s) and (if desired) additional materials. \nWe want to create a welcoming environment\, where all researchers can bring forward their Open Science experience\, regardless of their research interests\, career stage or level of expertise in Open Science. \nFind out more HERE.
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SUMMARY:The European Open Science Cloud (EOSC) and national/regional open science policy
DESCRIPTION:On the 16th of April\, the Belgian presidency cordially invites the Belgian and European Open Science Community to take part in the National EOSC tripartite event. This event follows the European Tripartite of EOSC on the same day. \nThe ambition of the European Open Science Cloud\, known as EOSC\, is to develop a ‘Web of FAIR Data and Services’ for science in Europe. Within a federated ‘system of systems’ approach it is the aim to provide European researchers from all scientific disciplines a multi-disciplinary environment where they can publish\, find and reuse data\, tools and services for research\, innovation and educational purposes. \nThe goal of this event is to bring together the Belgian and European Open Science community and exchange best practices in the field of Open Science and Open Data. Participants will be given the opportunity to present posters of ongoing projects and activities related to Open Science and integration in the European Open Science Cloud during a networking lunch. \nFurthermore\, there will be plenty of time for discussion and exchange of views during the afternoon session\, including an intervention of the European Tripartite\, a keynote on ethics in Open Science and a panel session on ongoing projects in the field of Open Science in Belgium. \nFind out more HERE.
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LOCATION:Palais des Académies\, Rue Ducale\, Brussels\, 11000\, Belgium
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SUMMARY:Year of Open Science Culminating Conference
DESCRIPTION:We would like to share information about this interesting conference with you: \nThe Center for Open Science (COS)\, in collaboration with NASA\, is hosting a no-cost\, online culminating conference on March 21 and 22\, 2024\, to showcase the outcomes\, coalition-building efforts\, and ongoing work stemming from the 2023 Year of Open Science (YOS). This event aims to unite YOS participating organizations\, U.S. federal agencies\, funders\, international policymakers\, universities\, and research institutions for knowledge exchange and the sharing of recommendations to advance open science policies and practices. Submissions are now being accepted through January 24\, 2024. Attendee registration will open later this month. \nMore information here: Call for Proposals: Year of Open Science Culminating Conference (cos.io)
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SUMMARY:2024 LOVE DATA WEEK
DESCRIPTION:JOIN THE 2024 LOVE DATA WEEK \nFrom March 11 to 15\, 2024\, the ADOC Lorraine data workshop offers you a series of events around research data as part of the International Love Data Week 2024. \nRegistrations are open from January 15 to February 23\, 2023. \nThe event will be filled with fun and stimulating activities; don’t miss it! \nClick here for more details.
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SUMMARY:Bake Off Science
DESCRIPTION:Date and time: November 26\, 2023 1:00 PM – 3:00 PM \nLocation: Machine room ThermoTechnisch Instituut\, Kasteelpark Arenberg 10\, 3001 Heverlee \nEvent type: DIY \nEvent format: in-person activity for persons from 0 to 99 years \nDo you have a passion for baking? Mix that with a touch of science\, and you have our unique Bake-Off Science event! \nWe invite 60 passionate bakers from all age groups to explore the science of baking. Through this sweet challenge\, you will discover how accuracy is crucial in science\, just like in baking recipes. \nRegister individually or form a team with family or friends. Conditions to participate? An oven\, basic baking tools\, a mixer\, and a heart for sweets. Pick up your baking ingredients and recipe in Leuven on November 24 or 25. Bake at home and present your masterpiece on Science Day on November 26! \nAn expert jury and the audience decide who deserves the Bake-Off Science crown! \nRegister via this form \nOrganised by: \nVeerle Van den Eynden\, Patrick Onghena\, Olivia Kirtley\, Magdalena Kozula\, moderator and two jury members \nAfter registering for this activity\, you will receive an email a few days before the event with instructions on picking up the ingredients. We also provide children’s activities during the event. \nOrganisation by: KU Leuven \nThis event was originally published Here. \nPicture credit: By Seksak Kerdkanno (kerdkanno) via Pixabay
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SUMMARY:Join our 2023 Tropentag workshop!
DESCRIPTION:Workshop 19: Making research transparent and reproducible – Creating a paradigm shift in Open Science!\nOrganiser:\nOSIRIS – Open Science to Improve Reproducibility in Science\nCZU – Czech University of Life Sciences Prague\nYPARD – Young Professionals for Agricultural Development \nTo join\, contact the OSIRIS Communications officer: comms4osiris@gmail.com\nDate: Wednesday\, 20/09/2023\, 08:30 – 11:30 h (CEST)\nIn-person workshop\nLocation: to be announced\nDescription:\nIt is crucial to ensure that this generation and the next are able to produce evidence-based results and have a clear path in conducting Reliable and Trustworthy scientific research. Currently\, the burden of improving reproducibility lies with the researchers\, as there are limited to no incentives to encourage active engagement in reproducibility and ideas for improvement have never been tested in practice. We need a paradigm and culture shift to reform the R&I (research and innovation) system both from the top down and the bottom up to regain overall trust in science.\nThis Open Science and reproducibility workshop will provide young researchers with ways to identify incentives and embed reproducibility in the strategy and design of research projects. They will understand the underlying drivers and effective interventions that increase evidence-based reproducibility at funding\, publishing\, university\, and researcher-level trough an interactive peer-to-peer exchange.\nThe reproducibility of scientific results is at the core of scientific progress. After all\, if a scientific finding is not reproducible and accessible\, it is untrustworthy and cannot form the basis of future research and innovation.\nJoin us at our Open Science workshop! \nMain purpose of the workshop:\nExpose the problem in understanding how to improve and increase reproducibility in Science.\nProvide concrete knowledge\, skills\, and best practices in reproducibility measures.\nEnable attendees to network and share experience in conducting Open Science in their field of expertise
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LOCATION:Campus Mitte of Humboldt-Universität zu Berlin\, Germany\, Dorotheenstrasse 24\, Berlin\, 10117\, Germany
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SUMMARY:Open science and reproducibility of research results (online event series and Open Science Café)
DESCRIPTION:3 online + 1 personal events (Open Science Café)\n\n\n\nOnline events \nSeptember 14\, 2023\, Thursday 13:30– 14:30\nTopic: Principles of Open Science (Dr. Lencsés Ákos\, KIFÜ) \nhttps://unimatehu-my.sharepoint.com/:v:/g/personal/var7240_uni-mate_hu/Eakm2AEcgvFDivtYEwHnqIoBecUA1pXHYlDivys6eUTkSg?e=f1pes3&nav=eyJyZWZlcnJhbEluZm8iOnsicmVmZXJyYWxBcHAiOiJTdHJlYW1XZWJBcHAiLCJyZWZlcnJhbFZpZXciOiJTaGFyZURpYWxvZy1MaW5rIiwicmVmZXJyYWxBcHBQbGF0Zm9ybSI6IldlYiIsInJlZmVycmFsTW9kZSI6InZpZXcifX0%3D \n  \nSeptember 21\, 2023\, Thursday 8:30– 9:30\nTopic: Open Access publication: Key points and options in open access publishing (Dr. Lencsés Ákos\, KIFÜ) \nhttps://unimatehu-my.sharepoint.com/:v:/g/personal/var7240_uni-mate_hu/EcuR-2GYvgtBg6cCrVx3Ic4B2cYEe09slaxgCrEIr4hy8w?e=j3sOjJ&nav=eyJyZWZlcnJhbEluZm8iOnsicmVmZXJyYWxBcHAiOiJTdHJlYW1XZWJBcHAiLCJyZWZlcnJhbFZpZXciOiJTaGFyZURpYWxvZy1MaW5rIiwicmVmZXJyYWxBcHBQbGF0Zm9ybSI6IldlYiIsInJlZmVycmFsTW9kZSI6InZpZXcifX0%3D \n  \nSeptember 28\, 2023\, Thursday 13:30– 14:30\nResearch data management: From the FAIR (Findable\, Accessible\, Interoperable\, Reusable) principles to the data management plan – overview (Dr. Lencsés Ákos\, KIFÜ) \nhttps://unimatehu-my.sharepoint.com/:v:/g/personal/var7240_uni-mate_hu/EQIwQGEbx7JEm1GAZW6YYoMBHfO0auKHgFN_QagDCAo8Hw?e=0yw0I9&nav=eyJyZWZlcnJhbEluZm8iOnsicmVmZXJyYWxBcHAiOiJTdHJlYW1XZWJBcHAiLCJyZWZlcnJhbFZpZXciOiJTaGFyZURpYWxvZy1MaW5rIiwicmVmZXJyYWxBcHBQbGF0Zm9ybSI6IldlYiIsInJlZmVycmFsTW9kZSI6InZpZXcifX0%3D \n  \nOpen Science Café \nVenue: MATE Szent István Campus\, MKK Room\nOctober 3\, 2023\, Tuesday: 13:00-15:10 \nIntroductory presentation:\n13:00 – 13:30  Topic: European Open Science Cloud (Mohácsi János\, KIFÜ) \n13:30 – 13:50 Topic: Research evaluation systems – guidelines and examples  (Dr. Kádárné Kelemen Ildikó\, KIFÜ) \n13:50 – 14:10 Topic: OSIRIS project and reproducibility of scientific results (Dr. Varga Mónika\, MATE Institue of Animal Sciences)\n14:10 -15:10 Open Science Café (Dr. Kádárné Kelemen Ildikó\, KIFÜ) \n  \nPresentations can be found HERE.
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SUMMARY:ENRIO 2023 Congress on Research Integrity Practice with OSIRIS participation
DESCRIPTION:Pre-Congress Session \nFoster Research Integrity in Europe: Bringing EU-Partners Together \n6th September 2023 14:00 – 18:30 \nPlease find more information and posters HERE. Or download the OSIRIS poster HERE. \n 
URL:https://osiris4r.eu/event/enrio-2023/
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SUMMARY:Reproducibility of scientific results and introduction of OSIRIS
DESCRIPTION:10:00 – 10:05 Opening: Prof. Dr. Katalin Posta\, Vice Rector for Science and Quality Assurance\, MATE\n10:05 – 10:25 Balázs Kápli\, National Research\, Development and Innovation Office\,:\nOpen Science from the viewpoint of funder – domestic and EU practice\n10:25 – 10:45 Fazekas-Paragh Judit\, Hungarian OpenAIRE NOAD\, Debrecen University:\nOpenAIRE: Open Science infrastructures\n10:45 – 11:05 Dr. Varga Mónika\, MATE\, MATE PI of OSIRIS:  Introduction to OSIRIS project\n11:05 – 11:15 Q&A \n11:15 – 11:20 Closing: Dr. Mezőszentgyörgyi Dávid\, Vice Rector for Strategy and Development\, MATE \nThe presentations can be found HERE.
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SUMMARY:Implementing Metascience: Putting Ideas into Practice
DESCRIPTION:Abstract \nMetascientists often identify areas for improvement in science\, and propose opportunities for change. Yet implementing these proposed changes is challenging and many ideas never gain traction following their initial proposal. This virtual symposium brings together researchers and practitioners to reflect on the process of translating metascientific research into tangible interventions to improve the way science is practiced\, disseminated\, and evaluated.\nThe moderated panel discussion will include brief\, action-focused introductory presentations of efforts to translate metascience into changes in behavior\, policy\, and practice at both the individual and institutional level. This will be followed by a moderated discussion on successes\, lessons learned\, and challenges\, which can help inform and inspire future implementation efforts in metascience and beyond. \nThis session will be moderated by Nicholas DeVito of the University of Oxford and has confirmed panelists discussing transparency in biomedical research and Registered Reports. The aim of this virtual symposium is to share knowledge and build a community across a broad group of stakeholders and disciplines working to bridge metascience into practice. \nWatch the recording. \n\n\n\n\n\nREGISTER NOW
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SUMMARY:Promoting Research Integrity Through Meta Research in the Publication Process
DESCRIPTION:Abstract \nThough the vast majority of journals endorse peer review as an approach to increase trust in the literature\, few make their publication process and all the associated data (e.g. submitted manuscripts\, peer review reports and editorial decisions of accepted and rejected manuscripts) available to evaluate effectiveness of interventions meant to improve the quality of the publication process. We argue that scholarly journals can and should do more to apply rigorous standards to their own peer review practices by opening up their manuscript management data for meta research. In this panel discussion\, we will present an overview of some of the issues in the journal publication processes that hinder research integrity\, and illustrate why increased transparency is needed. Followed by a journal’s perspective of what can be done to address this will be presented and we end with two case studies as examples. \nWatch the recording. \n  \n\n\n\n\nREGISTER NOW
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SUMMARY:Pourquoi parle-t-on d’une crise de la reproductibilité en science ?
DESCRIPTION:À l’occasion de ce webinaire\, Florian Naudet présentera les éléments ayant amené la communauté scientifique à se saisir de la question de l’existence d’une crise de la reproductibilité en science. Il montrera pourquoi la reproductibilité est un critère de fiabilité essentiel à la science et définira les différents aspects que revêt la notion de reproductibilité. \nD’abord la reproductibilité des méthodes\, qui indique que les procédures et les données de l’étude sont décrites avec suffisamment de précision pour pouvoir être exactement répétées par d’autres. Puis la reproductibilité des résultats\, qui correspond à l’obtention réelle de résultats identiques lors de la réalisation indépendante d’une nouvelle étude dont les procédures sont identiques à celles de l’étude initiale. Et enfin\, la reproductibilité des inférences\, qui va encore au-delà\, et prend en compte l’interprétation des résultats. Elle correspond au fait que des conclusions identiques puissent être faites à partir d’une ré-analyse de l’étude originale ou d’une nouvelle expérience. \nIl présentera également des travaux évaluant la reproductibilité dans différents domaines (psychologie\, biologie du cancer\, recherche clinique). Ces travaux\, en montrant que des difficultés à reproduire les résultats de nombreuses expériences sont fréquentes\, ont fait émerger le narratif d’une crise de la reproductibilité en science. \nAu-delà de vous faire réfléchir sur l’existence -ou non- d’une telle crise\, il présentera les solutions imaginées pour optimiser la reproductibilité de nos travaux de recherches. \n\n\n\nMluvčí (3)\n\n\n\n\n\n\nII \n\nIntervenant invité\n\nFlorian Naudet présentera ce webinaire. Florian est psychiatre\, professeur de thérapeutique à l’université et au CHU de Rennes\, chercheur à l’Institut de recherche en santé\, environnement et travail (Irset) et membre sénior à l’Institut universitaire de France. Il a une activité de « recherche sur la recherche » et s’intéresse en particulier à ce qui rend la recherche thérapeutique reproductible et digne de confiance.\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nII \n\nIntervenant invité\n\nClara Locher animera ce webinaire. Clara est pharmacologue et méthodologiste au Centre d’Investigation Clinique de Rennes (Inserm 1414). Elle est membre de la commission de la transparence de la Haute Autorité de Santé. Les recherches de Clara portent sur la qualité\, la transparence et la reproductibilité des essais étudiant les thérapies ciblées en oncologie\, ainsi que sur les outils de détection des pratiques éditoriales douteuses.\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nII \n\nIntervenant invité\n\nClara Locher animera ce webinaire. Clara est pharmacologue et méthodologiste au Centre d’Investigation Clinique de Rennes (Inserm 1414). Elle est membre de la commission de la transparence de la Haute Autorité de Santé. Les recherches de Clara portent sur la qualité\, la transparence et la reproductibilité des essais étudiant les thérapies ciblées en oncologie\, ainsi que sur les outils de détection des pratiques éditoriales douteuses.\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\nTato událost skončila
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SUMMARY:Year of Open Science: Culminating Conference
DESCRIPTION:The Center for Open Science (COS)\, in collaboration with NASA\, is hosting a no-cost\, online culminating conference on March 21 and 22\, 2024\, to showcase the outcomes\, coalition-building efforts\, and ongoing work stemming from the 2023 Year of Open Science (YOS). This event aims to unite YOS participating organizations\, U.S. federal agencies\, funders\, international policymakers\, universities\, and research institutions for knowledge exchange and the sharing of recommendations to advance open science policies and practices. \nFind out more HERE.
URL:https://osiris4r.eu/event/year-of-open-science-culminating-conference-2/
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SUMMARY:Recherche Reproductible: états des lieux (compte-rendu)
DESCRIPTION:Les premières journées du réseau français de la recherche reproductible se sont déroulées à l’Institut Pasteur les 8 et 9 mars 2023\, en mode hybride. L’objectif de ces journées était de dresser un état des lieux de la reproductibilité dans les domaines de la recherche scientifique en France\, en tenant compte de la diversité des disciplines et des pratiques. Les 2 jours ont été divisés en 6 sessions\, contenant des présentations de 10 minutes\, suivies à chaque fois d’une discussion générale. [slides] \n1. Reproductibilité observationnelle\nL’objectif de cette session était d’identifier les sources de non-reproductibilité dans le domaine observationnel\, les solutions envisagées\, et les nouvelles questions qui en émergent. \nAlexandre Hocquet a ouvert les journées en nous rappelant que\, depuis les années 1980\, les historiens des sciences travaillent sur la thématique de la reproductibilité en science\, mais que la communauté scientifique ne s’y intéresse que depuis la crise de la reproductibilité. Il a cité les recherches de Sabina Leonelli\, qui permettent de mieux cerner les multiples facettes de la reproductibilité et offre une catégorisation de ces facettes. La reproductibilité s’envisage de multiples façons\, y compris à l’intérieur du même domaine de recherche. [slides] \nTimothée Giraud est ensuite intervenu pour expliquer le point de vue des sciences humaines et sociales\, où les traitements numériques sont le quotidien. Les problèmes sont l’utilisation d’outils numériques avec interface graphique\, ne permettant pas une bonne traçabilité des étapes des analyses\, et l’utilisation de logiciels privateurs qui entrainent des problèmes de formats et de transparence des méthodes d’analyse. Les formations initiales abordent peu les outils et notions de la recherche reproductible\, et les personnes se forment par elles-mêmes\, sans acquérir les bonnes pratiques de programmation. [slides] \nThomas Vuillaume a présenté le projet européen ESCAPE (cluster pour la physique des particules et l’astronomie) en mettant notamment en avant les données FAIR\, les logiciels FAIR et les moyens techniques pour une recherche reproductible dans les grandes infrastructures de recherche partenaires d’ESCAPE. Il a expliqué que ces moyens techniques ne suffisent pas et que les chercheurs aussi doivent être “FAIR” (c’est-à-dire qui adoptent et appliquent les principes FAIR) et que la reproductibilité ne doit pas être un objectif dès le départ\, mais qu’il faut y tendre progressivement\, par étapes. [slides] \n2. Reproductibilité computationnelle\nL’objectif de cette session était d’identifier les sources de non-reproductibilité dans le domaine computationnel\, les solutions envisagées\, et les nouvelles questions qui en émergent. \nÀ partir d’un exemple en biophysique moléculaire\, Konrad Hinsen a montré les limites de la reproductibilité computationelle\, nous rappelant que la confusion entre un modèle scientifique (défini) et son implémentation informatique (variable) condamne presque tout effort de réplicabilité\, et que la négligence dans la gestion des environnement logiciel empêche la reproductibilité. On a fait du progrès au cours des dernières années\, mais il reste beaucoup de chemin à faire. [slides] \nRoberto Di Cosmo a poursuivi en faisant un historique de la prise de conscience des problèmes de reproductibilité en informatique et les efforts faits pour y pallier. La Digital Library de l’ACM s’efforce de lier article et code\, mais le code source n’est pas toujours publié avec l’article\, et quand il l’est\, il manque l’historique de dévéloppement\, essentiel pour le comprendre et le ré-utiliser. La communauté du machine learning est à l’origine de Papers with Code\, mais le lecteur est renvoyé directement à la plateforme de développement du code source\, ce qui ne permet pas d’identifier la version précise utilisée dans l’article et ne garantit pas un accès pérenne. Une solution existe pour préserver sur le long terme les codes sources et identifier précisément les versions associées aux publications : Software Heritage. Cette méthode permet notamment la conservation du code source\, le suivi des versions et un référence plus précis et sûr que des simples DOI. Elle est adoptées par des journaux comme IPOL\, eLife ou JTCAM. \nCamille Maumet nous a présenté les problèmes de reproductibilité en neuro-imagerie\, notamment autour de l’analyse des données – qui même si elle est automatique est soumise à de nombreux choix réalisés par des experts – et donc difficilement reproductible. Un autre problème est la taille de l’études\, qui n’est pas toujours suffisante pour conférer une puissance statistique adéquate. Pour y remédier\, des consortiums sont mis en place afin de mutualiser les données. Elle a aussi mentionné le nombre d’étapes dans les analyses\, entre données brutes et résultats finaux\, et la nécessité de travailler de façon collaborative au sein de la communauté pour mettre en place de bonnes pratiques. [slides] \nThomas Moreau a présenté l’environnement BenchOpt\, développé dans le cadre de l’apprentissage automatique. BenchOpt permet d’assurer la création de benchmarks collaboratifs et efficaces\, en combinant plusieurs langages dans un même benchmark. BenchOpt permet de comparer et de comprendre la variabilité de traitements de données d’une méthode à l’autre. Le but de benchopt n’est pas d’assurer une reproducibilité bit à bit\, mais plutot une reproducibilité statistique des resultats\, tout en promouvant une forme de maintenance des benchmarks\, pour que les resultats soit mis à jour avec les évolutions des softwares. [slides] \n3. Reproductibilité statistique\nL’objectif de cette session était d’identifier les sources de non-reproductibilité dans le domaine des méthodes statistiques\, les solutions envisagées\, et les nouvelles questions qui en émergent. \nAprès avoir rappelé le très faible taux de reproductibilité en économie\, Christophe Hurlin a présenté Cascad\, une UMS de certification de codes et de données qui permet de garantir la reproductibilité des articles. Cette UMS est aujourd’hui sollicitée par des journaux en économie et a déjà certifié une cinquantaine de codes. \nNelle Varoquaux a ensuite présenté les problématiques rencontrées en bio-physique\, biochimie et évolution où les facteurs de non-reproductibilité sont nombreux : origine des données\, annotations des génomes\, méthode d’analyses\, disponibilité et accessibilité du code\, temps de calcul parfois long qui empêche les ré-analyses. La nouvelle revue SFDS tente d’y remédier en publiant des analyses entièrement reproductibles\, et ce dans un temps raisonable. \nPour Isabelle Boutron\, la transparence pour les essais cliniques vient avant même la question de la reproductibilité de ces essais. Sous l’impulsion de Drumond Rennie\, le pré-enregistrement des protocoles des essais ainsi que des directives claires pour écrire les rapports sont devenus incontournables\, notamment pour éviter le “harking” ou post-hoc analysis. \n4. Reproductibilité expérimentale\nL’objectif de cette session était d’identifier les sources de non-reproductibilité en recherche expérimentale\, les solutions envisagées\, et les nouvelles questions qui en émergent. \nFay Betsou a commencé son intervention en soulignant qu’il existe d’innombrables facteurs de variabilité dans la préparation des échantillons biologiques\, avant même de réaliser des expériences à la paillasse. Ces facteurs sont rarement\, ou mal\, mentionnés dans les méthodes d’un article. Il est donc nécesaire d’avoir de nouveaux standards de rédaction de protocole et la traçabilité des données. \nFlorian Naudet nous a rappelé le cycle hypothetico-déductif et les déviances\, telles que le harking ou le p-hacking. A travers différents exemples\, il a insisté sur les conséquences de santé publique des difficultés à reproduire la recherche thérapeutique (e.g. rTMS\, antidépresseurs\, traitement du paludisme). Les solutions envisagées reposent sur une meilleure conception et l’enregistrement des études\, le partage des données\, la nécessité d’aligner les incitatifs et de former une nouvelle génération de chercheurs à ces enjeux. Il est important de mettre en oeuvre une approche de métarecherche permettant d’évaluer l’impact de ces solutions. \nFrançois Ric a présenté un bref historique de la reproductibilité en psychologie et comment la communauté s’est saisie du problème pour se réformer en profondeur\, notamment via l’Open Science Framework. Aujourd’hui\, le pré-enregistrement des études\, le partage des données et la transparence des méthodes ont été adoptés. [slides] \nYoann Lafon a présenté les problèmes de reproductibilité méthodologique en caractérisation de matériaux biologiques\, poussée notamment par les nouvelles réglementations pour la mise sur le marché des dispositifs médicaux autorisant le recours à la simulation numérique. Se posent alors le problème de la certification des données utilisées dans ces simulations. Un consortium international a donc rassemblé 25 équipes pour améliorer la reproductibilité de la caractérisation mécanique de tissus biologiques. Les membres du consortium ont travaillé sur les mêmes données\, d’abord avec des protocoles différents\, puis en appliquant un protocole unique issu d’un consensus. des travaux sont encore en cours pour réduire les incertitudes expérimentales. L’effet de ces incertitudes sur le comportement des modèles dépend finalement des paramètres de sortie utilisés pour répondre à la Question d’Intérêt. \n5. Formation et enseignement\nLa sensibilisation aux notions de reproductibilité dans le domaine de la recherche peut être effectuée en formation initiale\, dès le master\, ou dans le cadre professionnel. L’objectif de cette session a été de présenter des exemples actuellement mis en place dans certains masters\, et des solutions de formation dans le milieu professionnel. \nFrédéric Lemoine a présenté le Reprohackathon\, un module d’enseignement mis en place depuis 2020 dans le master AMI2B (Université Paris-Saclay\, ~40 étudiants/an) sur la reproductibilité computationnelle. Ce module est composé d’une partie théorique+pratique et d’un projet long\, consistant pour les étudiants en un travail de plusieurs mois en semi-autonomie. Les étudiants doivent comprendre la méthode utilisée dans un article pour ensuite la mettre en oeuvre via un workflow afin d’en reproduire les résultats. L’objectif est de comprendre l’intérêt de la reproductibilité et d’en connaître en profondeur les concepts techniques et outils. [slides] \nReproducibiliTea est une initiative anglaise reprise à Bordeaux par Eduarda Centeno et Fjola Hyseni. Elles nous ont présenté sa mise en place en 2021 ainsi que son organisation. Après deux ans\, elles ont organisé 18 sessions sur une variété de sujets sur la science ouverte et la reproductibilité\, y compris des sessions spéciales avec des invités de l’UNESCO\, FORRT et d’autres ‘ReproductibiliTea’s. Le BordeauxTea est devenu une formation doctorale sur l’ADUM\, donnant des heures et des certificats aux étudiants participants. [slides] \nLaurent Oudre nous a ensuite présenté un nouveau track d’enseignement dans le master MVA (ENS Paris-Saclay) composé d’un cours théorique et d’un cours pratique. Le but pour les étudiants est de pouvoir soumettre un article à la revue IPOL\, très exigeante sur les aspects de reproductibilité. [slides] \nArnaud Legrand a terminé la session en expliquant la genèse du MOOC “Recherche Reproductible”\, qui compte désormais plus de 13 000 participants depuis la troisième édition ouverte en 2020. Une suite de ce MOOC\, plus technique\, est appelée à se développer avec 3 modules en préparation : gestion des données\, contrôle des environnements logiciels et workflow scientifique. Ces modules seront disponibles à la fin de l’automne 2023. Ce retour d’expérience permet aussi de mettre en lumière la problématique de la sensibilisation de communautés variées : comment toucher efficacement des utilisateurs de domaines pouvant se percevoir éloignés de ces questions ? [slides] \n6. Europe et international\nDans de nombreux pays\, il existe des réseaux académiques nationaux dédiés à la question de la reproductibilité. Un des enjeux de ces journées a été de réfléchir à la définition et à la gouvernance d’un tel réseau\, à l’échelle nationale française. \nÉtienne Roesch a présenté le United Kingdom Reproducitibility Network (UKRN) fondé en 2018 en abordant son organisation\, ses financements et son développement. Ce réseau\, aujourd’hui composé de 70 noeuds locaux\, 25 universités et 50 “stakeholders”\, permet d’influer sur les politiques. Toutefois\, Étienne met en garde contre les risques de dérives : le reproducibility washing. [slides] \nVittorio Iacovella est le fondateur du réseau italien de reproductibilité (ITRN) qui a démarré en mars 2021\, à la suite de discussions datant de 2017. Le réseau se veut un lieu de formation\, de discussion\, d’organisation. Le réseau est aussi conçu pour permettre la formation de groupes de travail et est toujours en évolution. \nIsabelle Blanc a terminé la session en présentant le Comité pour la Science Ouverte (COSO) en expliquant notamment ses ambitions\, son organisation\, ses réalisations et son influence sur le paysage scientifique français\, européen et international. Le COSO pourrait être une structure d’accueil pour un futur réseau national français de la recherche reproductible. \nDiscussion générale\nCes deux journées se sont terminées par une discussion générale concernant l’avenir de la communauté de recherche reproductible en France. L’objectif de ces premières journées était de réaliser un état des lieux de la reproductibilité dans divers domaines de la recherche scientifique. Ces journées ont permis aux personnes intéressées de se réunir afin d’échanger sur les objectifs de créer une initiative nationale autours de la recherche reproductible\, et les prochaines étapes. Outre le sujet des financements\, la question des fonctions support dont le réseau a besoin pour se développer et se structurer a été notamment abordée et va être examinée. \nLes personnes présentes (physiquement ou en ligne) semblent enthousiastes à l’idée de se structurer. Une réunion en ligne sera bientôt organisée afin de poursuivre nos efforts. Un questionnaire va être diffusé afin de recenser\, à l’échelle nationale\, les initiatives locales de reproductibilité ; et de savoir quelles personnes seraient volontaires pour s’impliquer dans la mise en place d’un projet d’envergure nationale\, et dans quelle mesure.
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SUMMARY:Kick-off meeting
DESCRIPTION:To mark the official launch of OSIRIS\, the project consortium members will gather in Utrecht\, The Netherlands\, on the 14th & 15th of February\, 2023\, for our kick-off meeting. The meeting will be conducted in the form of a two-day interactive hybrid event hosted and organized by the University Medical Centre Utrecht (UMCU) .
URL:https://osiris4r.eu/event/event_01/
LOCATION:University Medical Centre Utrecht (UMCU)\, Heidelberglaan 100\, Utrecht\, Netherlands
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